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activemotif -ATAC-Seq試劑盒
產品時間：2022-12-20
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ATAC-Seq試劑盒
Assay for Transposase-Accessible Chromatin 通常簡稱為ATAC-Seq。ATAC-Seq方法依賴于使用超活性轉座酶Tn5構建二代測序（NGS）文庫。NGS測序所需的adapter被預加載到了Tn5轉座酶上，這允許染色質片段化和adapter的連接同步進行，生成的DNA文庫可以通過NGS進行測序，并使用生物信息學分析具有開放或可及染色質的基因組區域。
與其它技術（如FAIRE-Seq或DNase-Seq）相比，ATAC-Seq的主要優勢在于檢測所需的細胞數量較少，且實驗方法相對簡單。
ATAC-Seq實驗一般只需要大約50000個細胞作為起始材料，并且由于其相對較簡單的兩步法實驗步驟，使得它成為了開啟表觀研究的常用方法。無論您是想分析樣本中染色質的狀態，還是比較特殊處理前后的染色質狀態，ATAC-Seq都可以幫您研究全基因組染色質的變化，并可以為后續實驗中應該研究哪種表觀遺傳修飾或轉錄因子以及應該使用哪種方法來研究它們提供指導。
ATAC-Seq試劑盒
在全基因組范圍內分析開放的染色質區域。
ATAC-Seq試劑盒總覽
名稱格式貓號。價格 ATAC-Seq 試劑盒16 rxns 5315015,600購買尋找批量重組 Tn5轉座酶？引用一下。需要復用16個以上的樣品嗎？參見我們的 NexteraTM 兼容多重引物(96復)。
ATAC-Seq是一種快速檢測方法，可通過識別具有開放或可及狀態的染色質區域來分析整個基因組的表觀遺傳概況。ATAC-Seq方法快速，簡便，適用于廣泛的樣品類型，已成為常用的表觀遺傳學分析方法，并且可以作為更深入的表觀遺傳學分析的基礎。
在ATAC-Seq實驗中，用高活性的突變Tn5轉座酶處理來自細胞或組織樣品的完整細胞核。該轉座酶把DNA片段化的同時用測序接頭標記靶DNA。
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒提供了與Illumina®平臺兼容的ATAC-Seq文庫制備試劑，可以從20 – 30 mg組織或50,000 – 100,000個細胞中生成16種不同的ATAC-Seq文庫。經過優化的方案將指導您完成樣品制備、DNA片段標記和文庫構建的步驟，構建可在單個測序反應中進行多重測序的文庫。
ATAC-Seq試劑盒亮點
顯示開放染色質區域的基因組序列
僅需數小時即可完成NGS文庫制備
簡單，快速的實驗步驟與優化的試劑
ATAC-Seq試劑盒組分
ATAC-Seq試劑盒包含兩盒組分，其中-20°C保存的一盒組分干冰運輸，4°C保存的另一盒組分室溫運輸。次使用后，請根據說明書中的存放條件保存。妥善保管的試劑自收貨之日起可穩定保存6個月。
試劑包括
ATAC 裂解緩沖液，存儲在 RT 組裝的轉座體中，存儲在 -20 ° C 2X 標記緩沖液中，存儲在 -20 ° C 1X 標記緩沖液中，存儲在 -20 ° C 或 RT10X 標記緩沖液中，存儲在 RT10% 吐溫20，存儲在 RT1% 數字蛋白,存儲在 -20 ° C DNA 純化柱，存儲在 RTDNA 純化結合緩沖區，存儲在 RTDNA 純化洗滌緩沖區，存儲在 RTDNA 純化洗脫緩沖區，存儲在 RT3M 醋酸鈉，存儲在 RT10mM dNTP，存儲在 -20 ° C 5X Q5緩沖區，存儲在 -20 ° C Q5高保真 DNA 聚合酶,儲存在 -20 ° C i7索引引物1，儲存在 -20 ° C i7索引引物2，儲存在 -20 ° C i7索引引物3，儲存在 -20 ° C i7索引引引物4，儲存在 -20 ° C i5索引引物1，儲存在 -20 ° C i5索引引物2，儲存在 -20 ° C i5索引引引物3，儲存在 -20 ° C i5索引引引物4，儲存在 -20 ° C SPRI 珠，儲存在4 ° C
ATAC-Seq試劑盒數據
ATAC-Seq試劑盒包含進行16個ATAC-Seq反應所需的試劑和酶。這些試劑盒組分經過優化，可以高效工作，經驗證可以生成高質量的ATAC-Seq數據。
揭示啟動子處染色質的開放位置
具有轉錄活性的基因，其啟動子處的染色質通常是開放的或可及的。ATAC-Seq分析會在這些位置產生峰，揭示正在研究的樣品中開放的染色質區域。
圖1：ATAC-Seq試劑盒實驗結果展示在基因組瀏覽器中。ATAC-Seq試劑盒用于評估小鼠腦組織樣品的全基因組開放染色質狀態。此處顯示的基因組瀏覽器軌跡位于FOXP3基因位置，該基因編碼有絲分裂后神經元的生物標記物。峰表明在FOXP3基因的啟動子上有開放的染色質。
試劑盒實驗結果與已發表數據高度相關
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒可生成高質量數據。使用ATAC-Seq試劑盒產生的ATAC-Seq數據與已發表的ATAC-Seq數據具有很好的相關性，這突出說明了該檢測方法的可靠性和可重復性。
ATAC-Seq RKPM Data
圖2：ATAC-Seq試劑盒文庫與已發表的ATAC-Seq數據集的相關性。該圖顯示了在GM12878細胞中，已發表的ATAC-Seq(Buenrostro, J. D. et al. (2013) Nat. Methods 10: 1213-1218)數據的峰中的RPKM信號與使用試劑盒生成的數據集之間的相關性為0.94。
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